Сегодня правильно в аэропорту. Почему – сегодня? Потому что еще в начале шестидесятых годов двадцатого века в связи с широким развитием в нашей стране гражданской авиации в общелитературном употреблении — сначала в русском устном, а потом и в средствах массовой информации — распространилась форма на (-у) - в аэропорту. Значит, в середине века двадцатого нормативной была форма в аэропорте.
И как же это "в аэропорту" распространилось, откуда, спросите вы. Отвечу - из профессиональной речи лётчиков, работников аэродромов и аэропортов. Профессионалы вытеснили форму на (-е) - в аэропорте, да так, что теперь эта форма - устаревшая.
Профессионалы профессионалами, но вклад в победу формы на -у (в аэропорту) внесло и литературное сочетания "в порту".